ISSN: 1859 - 2872
Genetic diversity of cox1 mitochondrial gene among Opisthorchis viverrini isolated from patients in Phu Yen province
Main Article Content
Keywords
Abstract
Objectives: This study was conducted to analyze the genetic diversity of the mitochondrial cox1 gene of O. viverrini in Phu Yen province, Vietnam. Subject and method: Twenty adult O. viverrini individuals were collected from various patients in An My and An Hoa Hai communes, Tuy An district, Phu Yen Bai. Among them, eleven were sequenced to obtain the complete 1551 bp of cox1 gene sequences. Subsequently, the complete cox1 gene sequences were compared with reference sequences (JF739555.1, China) from GenBank to determine genetic diversity. Results: Fifteen polymorphic sites in the cox1 gene sequences of O. viverrini were identified at positions 15, 150, 152, 236, 321, 324, 354, 384, 407, 585, 738, 1257, 1275, 1305, and 1428. Nucleotide substitution at position 152 resulted in a Threonine → Methionine amino acid substitution, at position 236 in an Isoleucine → Asparagine change, and at position 407 in a Glycine → Alanine change. Conclusion: The mitochondrial cox1 gene sequences exhibit high genetic diversity and play an important role in analyzing the population genetic structure of the small liver fluke.
Article Details
References
2. Sripa B et al (2007) Liver Fluke Induces Cholangiocarcinoma. PLOS Medicine 4(7): e201.
3. Sripa B et al (2012) The tumorigenic liver fluke Opisthorchis viverrini - multiple pathways to cancer. Trends in Parasitology 28(10):395-407.
4. Sivanand A et al (2023) Associations of Liver Fluke Infection and Cholangiocarcinoma: A Scoping Review. Cureus 15(10): 46400.
5. Lê Thanh Hòa và cộng sự (2016) Xác định cấu trúc và đặc điểm gen học hệ gen ty thể của sán lá ruột nhỏ Haplorchis taichui (Trematoda: Heterophyidae), mẫu Việt Nam. Tạp chí Công nghệ Sinh học 14(2): 215-224.
6. Nguyễn Văn Tuấn và CS (2022) Phân tích đa hình gen ty thể cox1 của sán lá gan nhỏ Clonorchis sinensis thu thập tại 2 tỉnh Ninh Bình và Phú Thọ. Tạp chí Y Dược lâm sàng 108 17(4): 120-127.
7. Suwannahitatorn P et al (2024) Study of the population genetic structure of Opisthorchis-like eggs in northern Thailand using mitochondrial genes. PLOS Neglected Tropical Diseases 18(8): e0012445.
8. Khổng Minh Quang và cộng sự (2025) Xác định loài và phân tích đa hình di truyền gen cox1 của sán lá gan nhỏ thu thập từ người tại một xã thuốc tỉnh Yên Bái năm 2020. Tạp chí Y Dược học Quân sự 50(1):26-36.
9. Chelomina GN et al (2014) Genetic diversity of the Chinese liver fluke Clonorchis sinensis from Russia and Vietnam. International Journal for Parasitology 44(11):795-810.
10. Dung DT et al (2007) Fishborne Zoonotic Intestinal Trematodes, Vietnam. Emerg Infect Dis 13(12):1828-1833.
11. Lê Bách Quang và cộng sự (2011) Thực hành Ký sinh trùng và côn trùng Y học (giáo trình đại học). Nhà xuất bản Quân đội nhân dân; 2011.
12. Ando K et al (2001) Nucleotide sequence of mitochondrial COI and ribosomal ITS2 genes of Opisthorchis viverrini in northeast Thailand. The Southeast Asian journal of tropical medicine and public health 32(Suppl 2):17-22.
13. Saijuntha W et al (2008) Mitochondrial DNA sequence variation among geographical isolates of Opisthorchis viverrini in Thailand and Lao PDR, and phylogenetic relationships with other trematodes. Parasitology 135(12):1479-1486.
14. Petney TN et al (2018) Chapter One - Taxonomy, Ecology and Population Genetics of Opisthorchis viverrini and Its Intermediate Hosts. Advances in Parasitology. Academic Press; Volume 101: 1-39.
Article Sidebar
