ISSN: 1859 - 2872
Đánh giá giá trị phát hiện virus dengue bằng phương pháp real-time PCR đa mồi với bộ mồi và đầu dò tự thiết kế dựa trên trình tự virus dengue phân lập tại Việt Nam
Main Article Content
Keywords
Tóm tắt
Mục tiêu: Nghiên cứu có mục tiêu đánh giá quy trình real-time PCR đa mồi định type virus dengue sử dụng bộ sinh phẩm 108 DENV Real-time PCR với bộ mồi/đầu dò do nhóm nghiên cứu tự thiết kế dựa trên dữ liệu trình tự gen virus dengue phân lập tại Việt Nam. Đối tượng và phương pháp: Tổng số 284 mẫu bệnh phẩm máu của bệnh nhân chẩn đoán sốt xuất huyết dengue được thu thập tại Bệnh viện TƯQĐ 108 trong giai đoạn tháng 10/2021 đến tháng 12/2022, ở Hà Nội, được tách chiết RNA và sử dụng cho đánh giá bộ sinh phẩm 108 DENV Real-time PCR và so sánh với bộ sinh phẩm xét nghiệm của CDC Hoa Kỳ (CE-IVD). Kết quả: Bộ sinh phẩm tự thiết kế định type virus dengue có ngưỡng phát hiện 102 bản sao/μL, độ đặc hiệu kỹ thuật 100%. Nghiên cứu thực hiện định type trên 284 mẫu bệnh phẩm cho thấy bộ sinh phẩm tự thiết kế có độ nhạy phát hiện virus dengue nhỉnh hơn bộ sinh phẩm CDC (lần lượt là 71,5% dương tính và 63,0% dương tính). Kết luận: Như vậy, bộ sinh phẩm tự thiết kế có độ đặc hiệu kỹ thuật cao, độ nhạy trên mẫu bệnh phẩm chẩn đoán sốt xuất huyết dengue tương đương với bộ sinh phẩm CDC Hoa Kỳ.
Article Details
Các tài liệu tham khảo
2. Dwivedi VD, Tripathi IP, Tripathi RC, Bharadwaj S, Mishra SK (2017) Genomics, proteomics and evolution of dengue virus. Brief Funct Genomics 16(4): 217-227.
3. Hung TM, Clapham HE, Bettis AA et al (2018) The Estimates of the Health and Economic Burden of Dengue in Vietnam. Trends Parasitol 34(10): 904-918. doi:10.1016/j.pt.2018.07.007.
4. Phadungsombat J, Vu HTT, Nguyen QT, Nguyen HTV, Nguyen HTN, Dang BT, Nakayama EE, Ishizaki A, Ichimura H, Shioda T, Pham TN (2023) Molecular Characterization of Dengue Virus Strains from the 2019–2020 Epidemic in Hanoi, Vietnam. Microorganisms. 11(5):1267. doi: 10.3390/microorganisms11051267.
5. Vicente CR, Herbinger KH, Fröschl G, Romano CM, Cabidelle A de SA, Junior CC (2016) Serotype influences on dengue severity: A cross-sectional study on 485 confirmed dengue cases in Vitória, Brazil. BMC Infect Dis 16(1): 1-7.
6. Rocha BAM, Guilarde AO, Argolo AFLT et al (2017) Dengue-specific serotype related to clinical severity during the 2012/2013 epidemic in centre of Brazil. Infect Dis poverty 6(04): 73-83.
7. Centre for Disease Control and Prevention (2013) CDC DENV-1-4 Real-Time RT-PCR Assay for Detection and Serotype Identification of Dengue Virus The CDC Real Time RT-PCR Assay for Dengue Diagnosis. Cdc. Published online:1-5.
8. Vuong NL, Ha Quyen NT, Hanh Tien NT et al (2024) Dengue viremia kinetics and effects on platelet count and clinical outcomes: An analysis of 2340 patients from Vietnam. Published online. doi:10.7554/elife.92606.2.
9. Nabeshima T, Ngwe Tun MM, Thuy NTT et al (2023) An outbreak of a novel lineage of dengue virus 2 in Vietnam in 2022. J Med Virol 95(11): 29255.
10. Nguyễn Đức Thuận, Đặng Thành Chung (2021) Nghiên cứu Tỉ lệ type virus dengue ở bệnh nhân nhi trong một số đợt dịch tại khu vực miền Nam Việt Nam. Tạp chí Y học Việt Nam 503(1). doi:10.51298/vmj.v503i1.695.
11. Senaratne UTN, Senaratne UTN, Murugananthan K et al (2020) Dengue virus co-infections with multiple serotypes do not result in a different clinical outcome compared to mono-infections. Epidemiol Infect. Published online :0-8. doi:10.1017/S0950268820000229.
12. Dhanoa A, Hassan SS, Ngim CF et al (2016) Impact of dengue virus (DENV) co-infection on clinical manifestations, disease severity and laboratory parameters. BMC Infect Dis 16: 1-14.