Xây dựng quy trình xác định đa hình đơn nucleotide rs2062345 gen SOCS6 bằng phương pháp Tetra-primer ARMS PCR trên bệnh nhân nhiễm vi rút viêm gan B

  • Nguyễn Việt Phương Bệnh viện Quân y 103
  • Lê Văn Khánh Viện Nghiên cứu Y dược học Quân sự
  • Hoàng Văn Tổng Viện Nghiên cứu Y dược học Quân sự
  • Nguyễn Thanh Tuấn Bệnh viện Trung ương Quân đội 108
  • Vũ Duy Minh Bệnh viện Trung ương Quân đội 108
  • Trần Viết Tiến Bệnh viện Quân y 103

Main Article Content

Keywords

Đa hình đơn nucleotide, gen SOCS6, Tetra-primer ARMS PCR

Tóm tắt

Mục tiêu: Xây dựng quy trình phát hiện điểm đa hình đơn nucleotide (SNP) rs2062345 gen SOCS6 trên bệnh nhân mang virus viêm gan B bằng phương pháp Tetra-primer ARMS PCR (T-ARMS PCR). Đối tượng và phương pháp: Mẫu máu tĩnh mạch bệnh nhân mang virus viêm gan B (viêm gan, xơ gan, ung thư gan); sử dụng phương pháp T-ARMS PCR, có đối chiếu một số mẫu đại diện với phương pháp giải trình tự gen Sanger. Kết quả: Đã tối ưu được quy trình phản ứng T-ARMS PCR nhằm phát hiện SNP rs2062345 gen SOCS6; các kết quả điện di PCR đều rõ nét, không xuất hiện băng phụ phù hợp với kiểu gen của SNP rs2062345 gen SOCS6. Kết quả thí nghiệm T-ARMS PCR hoàn toàn tương đồng với phương pháp giải trình tự gen Sanger. Kết luận: Đã xây dựng thành công quy trình xác định SNP rs2062345 trên gen SOCS6 bằng phương pháp T-ARMS PCR.

Article Details

Các tài liệu tham khảo

1. Li X, Liu X, Tian L et al (2016) Cytokine-mediated immunopathogenesis of hepatitis B virus infections. Clinical reviews in allergy immunology 50(1): 41-54.
2. Mathew S, Abdel-Hafiz H, Raza A et al (2016) Host nucleotide polymorphism in hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma. World J Hepatol 8(10): 485-498.
3. Linossi EM, Babon JJ, Hilton DJ et al (2013) Suppression of cytokine signaling: The SOCS perspective. Cytokine and growth factor reviews 24(3): 241-248.
4. Hoan NX, Van Tong H, Giang DP et al (2017) SOCS3 genetic variants and promoter hypermethylation in patients with chronic hepatitis B. Oncotarget 8(10): 17127-17139.
5. Zhang P, Li F, Li N et al (2014) Genetic variations of SOCS1 are associated with chronic hepatitis B virus infection. Human Immunology 75(8): 709-714.
6. Yuan D, Wang W, Su J et al (2018) SOCS6 functions as a tumor suppressor by inducing apoptosis and inhibiting angiogenesis in human prostate cancer. Curr Cancer Drug Targets 18(9): 894-904.
7. Medrano RF, de Oliveira CA (2014) Guidelines for the tetra-primer ARMS-PCR technique development. Mol Biotechnol 56(7): 599-608.
8. Ye S, Dhillon S, Ke X et al (2001) An efficient procedure for genotyping single nucleotide polymorphisms. Nucleic Acids Res 29(17): 88-88.
9. Honardoost MA, Tabatabaeian H, Akbari M et al (2014) Investigation of sensitivity, specificity and accuracy of Tetra primer ARMS PCR method in comparison with conventional ARMS PCR, based on sequencing technique outcomes in IVS-II-I genotyping of beta thalassemia patients. Gene 549(1): 1-6.
10. Linjawi S, Alsharef Z, Sindi S et al (2019) Tetra-primer ARMS-PCR as an efficient alternative for SNPs detection in molecular diagnostic: A comparison study. European Journal of Pharmaceutical and Medical Research 6(11): 91-96.

Article Sidebar

PDF
Đã đăng
Aug 7, 2023
DOI: https://doi.org/10.52389/ydls.v18i5.1901
Số tạp chí
Tập 18 - Số 5/2023
Chuyên mục
Articles
Trích dẫn bài viết này
PhươngN. V., KhánhL. V., TổngH. V., TuấnN. T., MinhV. D., & TiếnT. V. (2023). Xây dựng quy trình xác định đa hình đơn nucleotide rs2062345 gen SOCS6 bằng phương pháp Tetra-primer ARMS PCR trên bệnh nhân nhiễm vi rút viêm gan B. Journal of 108 - Clinical Medicine and Phamarcy, 18(5). https://doi.org/10.52389/ydls.v18i5.1901