Tối ưu quy trình Nested RT-PCR và phân tích đặc điểm phân tử virus viêm gan E trên mẫu gan lợn thu thập tại Hà Nội

Tóm tắt

Mục tiêu: Tối ưu các thành phần tham gia phản ứng và xác định độ nhạy, độ đặc hiệu của phương pháp Nested RT-PCR phát hiện HEV. Áp dụng phương pháp Nested RT PCR để xác định tỷ lệ nhiễm và phân tích đặc điểm sinh học phân tử HEV trên mẫu gan lợn thu thập tại thành phố Hà Nội năm 2025. Đối tượng và phương pháp: Nghiên cứu thực nghiệm trong phòng xét nghiệm sinh học phân tử kết hợp với nghiên cứu mô tả cắt ngang trên 298 mẫu gan lợn thu thập tại Hà Nội. Kết quả: Phản ứng Nested RT-PCR được tối ưu với nhiệt độ gắn mồi 56⁰C, thời gian kéo dài 50 giây cho vòng ngoài và 54⁰C, 40 giây cho vòng trong. Trên 298 mẫu gan lợn, kết quả có 24 mẫu (8,05%) dương tính với HEV bằng phương pháp Nested RT PCR. Phân tích phát sinh loài qua 11 chủng được giải trình tự cho thấy các chủng đều thuộc kiểu gen HEV-3, trong đó 9/11 thuộc subtype HEV-3a, 1/11 HEV-3e và 1/11 HEV-3f-like. Kết luận: Nghiên cứu tối ưu thành công phương pháp Nested RT-PCR phát hiện HEV trong gan lợn. Các mẫu dương tính đều thuộc kiểu gen HEV-3, phù hợp với các chủng lưu hành trong khu vực.