ISSN: 1859 - 2872
Tạo bộ mẫu chuẩn định lượng tuyệt đối một số RNA dài không mã hóa phục vụ nghiên cứu ung thư biểu mô tế bào gan
Main Article Content
Keywords
Tóm tắt
Mục tiêu: Ung thư biểu mô tế bào gan (UTBMTBG) là loại ung thư có tỷ lệ tử vong cao. Long non-coding RNA (lncRNA) là RNA không mã hóa protein, được xem như dấu ấn sinh học tiềm năng cho chẩn đoán sớm ung thư. Nghiên cứu thực hiện nhằm tạo vector tái tổ hợp mang gen mã hóa một số lncRNA, nhân dòng trong E. coli và thiết lập bộ mẫu chuẩn phục vụ định lượng tuyệt đối. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: lncRNA lựa chọn gồm LINC02560, LINC02487, HCG22, HNF4A-AS1, C5orf66-AS1. Các kỹ thuật chính gồm PCR, tái tổ hợp, nhân dòng và định lượng tuyệt đối bằng Real-time PCR. Kết quả: năm vector tái tổ hợp mang gen lncRNA được nhân dòng thành công trong E. coli và các bộ mẫu chuẩn định lượng tuyệt đối đã được thiết lập. Các mẫu đạt hiệu suất khuếch đại cao (95,45-109,14%), đặc hiệu và lặp lại tốt (CV% < 10%), tuyến tính cao (R2 > 0,99). Kết luận: Kết quả này tạo cơ sở quan trọng cho nghiên cứu định lượng lncRNA trong UTBMTBG, góp phần chẩn đoán sớm và tiên lượng điều trị ung thư gan.
Article Details
Các tài liệu tham khảo
2. Observatory GC (2025) GLOBOCAN 2022: Viet Nam Fact Sheet. International Agency for Research on Cancer (IARC), World Health Organization. Updated https://gco.iarc.who.int/media/globocan/factsheets/populations/704-viet-nam-fact-sheet.pdf
3. Patresan J, Patel H, Chandrasekaran K, Reynolds G (2024) Current Treatment Paradigm and Approach to Advanced Hepatocellular Carcinoma. Cureus 16(12): 75471. doi:10.7759/cureus.75471
4. Mittal S, El-Serag HB (2013) Epidemiology of hepatocellular carcinoma: consider the population. J Clin Gastroenterol 47 Suppl(0): 2-6. doi:10.1097/MCG.0b013e3182872f29
5. Li Y, Egranov SD, Yang L, Lin C (2019) Molecular mechanisms of long noncoding RNAs-mediated cancer metastasis. Genes Chromosomes Cancer 58(4): 200-207. doi:10.1002/gcc.22691
6. Jansone B, Kadish I, van Groen T et al (2016) Memory-enhancing and brain protein expression-stimulating effects of novel calcium antagonist in Alzheimer’s disease transgenic female mice. Pharmacological Research 113: 781-787. doi:https://doi.org/10.1016/j.phrs.2016.06.020
7. Sang J, Wang Z, Li M et al (2017) ICG: A wiki-driven knowledgebase of internal control genes for RT-qPCR normalization. Nucleic Acids Research. 46(D1):D121-D126. doi:10.1093/nar/gkx875
8. Hays A, Islam R, Matys K, Williams D (2022) Best Practices in qPCR and dPCR Validation in Regulated Bioanalytical Laboratories. The AAPS Journal 24(2): 36. doi:10.1208/s12248-022-00686-1.
9. Hashish A, Sinha A, Sato Y, Macedo NR, El-Gazzar M (2022) Development and Validation of a New TaqMan Real-Time PCR for the Detection of Ornithobacterium rhinotracheale. Microorganisms 10(2): 341.
10. Li X, Xiao X, Chang R, Zhang C (2020) Comprehensive bioinformatics analysis identifies lncRNA HCG22 as a migration inhibitor in esophageal squamous cell carcinoma. Journal of Cellular Biochemistry 121(1): 468-481. doi:https://doi.org/10.1002/jcb.29218
11. Wapinski O, Chang HY (2011) Long noncoding RNAs and human disease. Trends in Cell Biology 21(6): 354-361. doi:10.1016/j.tcb.2011.04.001
12. Quinn JJ, Chang HY (2016) Unique features of long non-coding RNA biogenesis and function. Nature Reviews Genetics 17(1): 47-62. doi:10.1038/nrg.2015.10
13. Tang X, Shang J, Ji Y, Sun Y (2023) PLASMe: A tool to identify PLASMid contigs from short-read assemblies using transformer. Nucleic Acids Res 51(15): 83. doi:10.1093/nar/gkad578
14. Bustin SA, Benes V, Garson JA et al (2009) The MIQE guidelines: minimum information for publication of quantitative real-time PCR experiments. Clin Chem. Apr 55(4): 611-22. doi:10.1373/clinchem.2008.112797
15. Nguyễn MN, Nguyễn TTD, Đinh TTH và cộng sự (2024) Xây dựng đường chuẩn để định lượng nồng độ long non-coding RNA IFI6lnc2 và EPB41L4A-AS1 bằng phương pháp Real-time PCR. Tạp chí Y Dược học Quân sự 49(2): 245-255. doi:10.56535/jmpm.v49i2.720
Article Sidebar
