ISSN: 1859 - 2872
Thiết lập phương pháp phát hiện Human metapneumovirus gây viêm phổi ở người bằng kỹ thuật RT-qPCR
Main Article Content
Keywords
Tóm tắt
Mục tiêu: Xây dựng phương pháp phát hiện Human metapneumovirus (hMPV) gây viêm phổi ở người bằng kĩ thuật RT-qPCR. Đối tượng và phương pháp: Mẫu chứng dương plasmid tổng hợp có chứa trình tự hMPV được sử dụng trong nghiên cứu này. Ngưỡng phát hiện, độ nhạy kỹ thuật được thực hiện trên mẫu chứng dương pha loãng giảm dần nồng độ từ 105÷100. Mồi và probe được thiết kế bằng cách sử dụng trình tự hMPV trong cơ sở dữ liệu NCBI (National Center for Biotechnology Information). Độ đặc hiệu của kỹ thuật được đánh giá dựa trên khả năng không bắt chéo với các virus khác. Một phản ứng khuếch đại nội chuẩn để đánh giá hiệu quả tách chiết và kiểm soát chất ức chế của phản ứng. Thực hiện so sánh kết quả chạy trên mẫu thực tế với kit Seegene. Kết quả: Ngưỡng phát hiện hMPV là 1 copy/ µL, độ nhạy và độ đặc hiệu của kỹ thuật tương ứng 95%, 100%, kết quả chạy trên mẫu thực tế tương đồng với kit Seegene. Kết luận: Đã thiết lập thành công phương pháp RT-qPCR trong phát hiện Human metapneumovirus với độ nhạy, độ đặc hiệu kỹ thuật cao trên mẫu chứng dương plasmid.
Article Details
Các tài liệu tham khảo
2. Choudhary ML et al (2014) Development of real-time RT-PCR for detection of human metapneumovirus and genetic analysis of circulating strains (2009-2011) in Pune, India. Arch Virol 159(2): 217-225.
3. Nguyen Dai Thuc, D.N.A.T., Nguyen Ngoc Tan, Nguyen Thu Ngoc (2019) Detection influenza a virus and human pneumovirus (hMPV) on nasopharyngeal specimen by using mutiplex RT-PCR. Ho Chi Minh City Journal of Medicine 23(5): 251-258.
4. Zhou Z et al (2020) Experiments Investigating the Competitive Growth Advantage of Two Different Genotypes of Human Metapneumovirus: Implications for the Alternation of Genotype Prevalence. Scientific Reports 10(1): 2852.
5. Gaunt ER et al (2011) Molecular epidemiology and evolution of human respiratory syncytial virus and human metapneumovirus. PLoS One 6(3): 17427.
6. Forootan A et al (2017) Methods to determine limit of detection and limit of quantification in quantitative real-time PCR (qPCR). Biomol Detect Quantif 12: p. 1-6.
Article Sidebar
